El Ministerio realiza seguimiento a la gestión territorial e institucional que se requiere para garantizar el acceso, atención y el cumplimiento de los mandatos y ordenes dirigidas a las víctimas del conflicto armado, a través del reporte de atenciones realizadas por los equipos psicosociales en territorio y el reporte de las secretarias de salud sobre las actividades relacio​nadas con los programas de atención a víctimas del conflicto armado, incluidas en los planes territoriales y su ejecución.

Mediante la herramienta informática PAPSIVI, se suministra información que permite dar respuesta a los diferentes requerimientos, conocer los avances en el Goce Efectivo de Derechos y medir la gestión territorial, además medir el avance en la implementación de las medidas de asistencia integral en salud y la rehabilitación física, mental y psicosocial a víctimas, y  brindar insumos para evaluar los  resultados de la implementación de las medidas de atención integral en salud y atención psicosocial a personas víctimas. ​