La Subdirección de Pensiones y Otras Prestaciones es la dependencia del Ministerio de Salud y Protección Social responsable de apoyar y coordinar la definición de los mecanismos de afiliación y registro de los afiliados al Sistema General de Seguridad Social Integral, así como de los aportes parafiscales. Igualmente, en articulación con otras dependencias del Ministerio y entidades competentes, define los procesos relacionados con la afiliación, registro y control en el marco del Sistema General de Pensiones.
También apoya la participación del Ministerio en la Comisión Intersectorial de Pensiones y Beneficios Económicos que se establezca para estos fines, contribuyendo a la formulación y evaluación de políticas, planes, programas y proyectos en materia de pensiones, beneficios económicos y otras prestaciones.
Por estas razones, esta subdirección se encarga de reglamentar la Planilla Integrada de Liquidación de Aportes (PILA), el Registro Único de Afiliados (RUAF), y de apoyar el SAT en pensiones y en las Cajas de Compensación Familiar.